<?xml version="1.0" encoding="utf-8" standalone="yes"?><rss version="2.0" xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom" xmlns:content="http://purl.org/rss/1.0/modules/content/"><channel><title>M6A on Superhyydl's Blog</title><link>https://blog.superhyydl.org/tags/m6a/</link><description>Recent content in M6A on Superhyydl's Blog</description><generator>Hugo</generator><language>zh-cn</language><lastBuildDate>Tue, 01 Sep 2026 00:00:00 +0000</lastBuildDate><atom:link href="https://blog.superhyydl.org/tags/m6a/index.xml" rel="self" type="application/rss+xml"/><item><title>精读 | YTHDC1：TNBC 代谢重编程的枢纽与双刃剑</title><link>https://blog.superhyydl.org/reading/ythdc1-orchestrates-glucose-and-glutamate-rewiring/</link><pubDate>Tue, 01 Sep 2026 00:00:00 +0000</pubDate><guid>https://blog.superhyydl.org/reading/ythdc1-orchestrates-glucose-and-glutamate-rewiring/</guid><description>&lt;h2 id="一句话亮点"&gt;一句话亮点&lt;/h2&gt;
&lt;p&gt;这篇《Advanced Science》研究发现，m6A 阅读器 YTHDC1 在 TNBC 中特异性高表达，它像一位&amp;quot;代谢指挥家&amp;quot;：一手稳定 GLUT3 mRNA 保糖供 NADPH，一手降解 ATF4 mRNA 抑制 SLC7A11 防胱氨酸超载；敲低 YTHDC1 则同时断糖并释放 SLC7A11，触发双硫死亡；而绕过 YTHDC1 直接递送 ATF4 mRNA，则能分别配合 GLUT 或 GLS 抑制剂，主动将 TNBC 推向代谢崩溃。&lt;/p&gt;
&lt;h2 id="背景痛点"&gt;背景/痛点&lt;/h2&gt;
&lt;p&gt;三阴性乳腺癌（TNBC）恶性度高、易复发，靶向治疗选择有限。癌症细胞代谢可塑性极强，堵一条路，它立马绕道，单药效果往往不理想。因此，寻找能&amp;quot;按住多个代谢开关&amp;quot;的枢纽分子，是 TNBC 治疗的重要方向。&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;m6A 修饰是 RNA 上最丰富的修饰，其阅读器（Reader）能同时调控一群 mRNA 的命运。但这么多阅读器，哪个在 TNBC 里最关键？它们具体在代谢网络中&amp;quot;按住&amp;quot;了哪些开关？搞清楚这些，才可能找到高效又相对特异的干预靶点。&lt;/p&gt;
&lt;h2 id="推理链分步拆解"&gt;推理链分步拆解&lt;/h2&gt;
&lt;h3 id="step-1ythdc1-为何值得看从患者数据到代谢表型"&gt;Step 1：YTHDC1 为何值得看——从患者数据到代谢表型&lt;/h3&gt;
&lt;p&gt;作者并没有直接扑向某个明星代谢基因，而是先问了一个根本问题：10 个主要 m6A 调控因子里，谁跟 TNBC 患者预后最相关？通过 Kaplan-Meier 分析，他们锁定 YTHDC1 和 FTO。但 CPTAC 蛋白数据发现，只有 YTHDC1 在肿瘤中显著高表达，且在 TNBC 亚型中更高。&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;接着他们在 TNBC 细胞系中敲低 YTHDC1，发现细胞增殖受抑、死亡增加。通过 RNA-seq、m6A-seq 和 YTHDC1 RIP-seq 三组学交叉，鉴定出 347 个高置信度的 m6A 依赖靶基因，GO 富集直指&amp;quot;细胞代谢过程&amp;quot;。代谢组学也证实，YTHDC1 敲低后，糖酵解、磷酸戊糖途径（PPP）、谷氨酸代谢通路均受影响。&lt;/p&gt;</description></item><item><title>精读 | IGF2BP1 靠 m6A 稳住铁蛋白 FTH1、抑制铁死亡，撑起胰腺癌吉西他滨耐药</title><link>https://blog.superhyydl.org/reading/igf2bp1-pdac/</link><pubDate>Sun, 16 Aug 2026 00:00:00 +0000</pubDate><guid>https://blog.superhyydl.org/reading/igf2bp1-pdac/</guid><description>&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;胰腺癌扛住吉西他滨，靠的是 m6A 阅读器 IGF2BP1 把铁蛋白 FTH1 的 mRNA「藏」进应激颗粒，稳住铁库、抑制铁死亡。&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;p&gt;胰腺癌（PDAC）又凶又难治，五年生存率不到 10%，超过 80% 的病人确诊时已经局部晚期或转移，手术做不了，只能靠化疗。吉西他滨是标准一线，但响应率不到 20%，还有超过 74% 的病人会复发进展，而且耐药来得飞快。搞清楚癌细胞到底怎么耐受吉西他滨，是提高疗效绕不过去的坎。&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;这篇把切入点放在表观转录组。m6A 是 mRNA 上一种可逆修饰，由 writer（甲基转移酶）和 eraser（去甲基化酶）动态调控，reader（YTHD 家族、IGF2BP 家族）则决定这些被修饰的 RNA 是稳定还是降解。IGF2BP1 是近年确认的一个 m6A reader，在结直肠癌、卵巢癌、骨肉瘤、胃癌里都驱动恶性进展，但它在 PDAC、尤其是耐药场景里扮演什么角色，之前没讲清楚。&lt;/p&gt;
&lt;h2 id="第一步先建耐药模型再找谁在耐药里涨得最凶"&gt;第一步：先建耐药模型，再找谁在耐药里「涨」得最凶&lt;/h2&gt;
&lt;p&gt;他们先把耐药模型铺了两条腿。一条是细胞：BxPC-3 和 CFPAC-1 两株胰腺癌细胞，用逐步加量的吉西他滨连续筛了 6 个月，做出 BxPC-3/GR、CFPAC-1/GR 两株耐药系，IC50 抬升了至少 10 倍。另一条是 PDX：把病人肿瘤碎片种进免疫缺陷鼠，连续传三代（F1 到 F3）并持续用吉西他滨筛选，要求耐药指数（RI）超过 150%。&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;然后做转录组，把耐药细胞和亲本细胞对比，再整合 TCGA、GTEx 和 GEO（GSE154909）里的数据，找「在肿瘤 vs 正常、耐药 vs 敏感、耐药 PDX 里都一致上调」的基因。IGF2BP1 就这么冒出来了。更关键的是临床证据：45 例化疗前的穿刺活检，按 RECIST1.1 分成 PD（进展，即耐药，n=16）和 PR（部分缓解，即敏感，n=4），治疗前多重免疫荧光显示，PD 组 IGF2BP1 基线表达更高；高 IGF2BP1 的 PDX 对吉西他滨反应也更差。&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;img alt="Fig. 1：IGF2BP1 在吉西他滨耐药 PDAC 里高表达，并与不良临床结局相关" loading="lazy" src="https://blog.superhyydl.org/images/reading/igf2bp1-pdac/fig1.png"&gt;&lt;/p&gt;</description></item></channel></rss>